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學(xué)術(shù)活動(dòng)

國(guó)際膜生物學(xué)與環(huán)境研究中心在Plant Journal上發(fā)文揭示豌豆頂芽對(duì)缺硼的細(xì)胞特異性響應(yīng)

2023-10-07

食品科學(xué)與工程學(xué)院國(guó)際膜生物學(xué)與環(huán)境研究中心在豌豆頂芽對(duì)缺硼的細(xì)胞特異性響應(yīng)研究取得了重要進(jìn)展,,研究成果已于10月5日在一區(qū)Top期刊Plant Journal上發(fā)表,,題為“Single-cell transcriptomic analysis of pea shoot development and cell-type-specific responses to boron deficiency”。

隨著全球食品需求的持續(xù)增長(zhǎng),提高作物產(chǎn)量及其對(duì)環(huán)境壓力的適應(yīng)性已變得尤為關(guān)鍵,。該研究深入探討了植物如何應(yīng)對(duì)缺硼脅迫,,為我們提供了提高作物產(chǎn)量的新途徑,。本研究通過(guò)對(duì)缺硼條件下豌豆頂芽進(jìn)行單細(xì)胞RNA測(cè)序,,識(shí)別了15個(gè)基于基因表達(dá)模式的細(xì)胞簇,深入的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄水平分析揭示了不同細(xì)胞類(lèi)型對(duì)缺硼的獨(dú)特反應(yīng),,如缺硼導(dǎo)致葉肉細(xì)胞(MC)中光合作用相關(guān)基因的表達(dá)降低,,這與光合效率的下降相符。另外,,與缺硼引起的氣孔密度減少相一致,,保衛(wèi)細(xì)胞中的氣孔發(fā)育基因(如MUTE和TOO MANY MOUTHS的同源基因)表達(dá)也有所降低。研究進(jìn)一步探討了頂芽分生組織(SAM)細(xì)胞的發(fā)育軌跡及其與轉(zhuǎn)錄因子的交互網(wǎng)絡(luò),。從SAM到MC的發(fā)育過(guò)程中,,編碼組蛋白和染色質(zhì)組裝及重塑相關(guān)基因的上調(diào)起到了關(guān)鍵作用,其中涉及FASCIATA1 (FAS1)和SWITCH DEFECTIVE/SUCROSE NON-FERMENTABLE (SWI/SNF)復(fù)合物的基因調(diào)節(jié),。但是,,缺硼條件下,這些基因的表達(dá)被抑制,,這可能解釋了在缺硼脅迫下分生組織發(fā)育受到的影響,。

與傳統(tǒng)的大多數(shù)組織RNA-seq分析相比,這項(xiàng)研究具有更高的分辨率,,因?yàn)閭鹘y(tǒng)方法往往會(huì)忽略細(xì)胞類(lèi)型特異性的反應(yīng),。因此,單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)為我們提供了更精確的工具,,以深入了解植物對(duì)缺硼脅迫的生理反應(yīng),。該研究是第一篇正式發(fā)表的豆科頂芽單細(xì)胞測(cè)序文章。

該研究得到了國(guó)家自然科學(xué)基金等項(xiàng)目的資助,。佛山科學(xué)技術(shù)學(xué)院和西澳大學(xué)聯(lián)合培養(yǎng)博士研究生陳曦為論文第一作者,,佛山科學(xué)技術(shù)學(xué)院喻敏教授,塔斯馬尼亞大學(xué)Steven Smith教授為共同通訊作者,。名古屋大學(xué)Mikio Nakazono教授和Hirokazu Takahashi副教授以及佛山科學(xué)技術(shù)學(xué)院碩士研究生茹嫣琦參與了該項(xiàng)目研究,。

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此外,今年2月5日,,國(guó)際膜生物學(xué)與環(huán)境研究中心在一區(qū)Top期刊Journal of Experimental Botany上還發(fā)表了題為“Phytohormones in plant responses to boron deficiency and toxicity”的綜述文章,,陳曦為論文第一作者,,喻敏教授為通訊作者,,塔斯馬尼亞大學(xué)Steven Smith教授參與了研究。

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